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Para pasar ficheros MOD (.mod, .s3m, .xm, etc.) a MP3 u OGG, necesitamos primero convertirlos a WAV. La mayoría de reproductores actuales permiten este tipo de conversión, pero para hacerlo desde línea de comandos, el único que he encontrado ha sido mikmod (disponible en Debian y Ubuntu en el paquete con el mismo nombre).

Los pasos son los siguientes:

1. Pasamos a WAV:
mikmod -d 4 --hqmixer -X fichero.mod

2. Codificamos en MP3 u OGG:
lame -h music.wav fichero.mp3
oggenc -o fichero.mp3 music.wav